Facturación Electrónica para el Sector Salud

Clínicas, consultorios y laboratorios: exención de ITBIS, facturación a ARS y honorarios médicos

El sector salud tiene una combinación fiscal que no se repite en ninguna otra industria: sus servicios están exentos de ITBIS, pero sus compras no lo están; factura a dos contrapartes por un mismo acto (la aseguradora y el paciente); y paga honorarios a médicos que son personas físicas, con la retención que eso implica.

Si a eso se suma que la facturación electrónica ya es obligatoria para las clínicas grandes y medianas, y que los consultorios pequeños tienen plazo hasta el 15 de noviembre de 2026, conviene entender bien el terreno antes de migrar.

Lo que hace distinto al sector salud

1. Los servicios de salud están exentos de ITBIS

La exención está en el artículo 344 del Código Tributario (Ley 11-92), que exime los servicios dirigidos a la prevención, diagnóstico, tratamiento y cura de enfermedades físicas o mentales. Quedan cubiertos:

• Servicios hospitalarios y clínicos.
• Consultas médicas.
• Servicios de enfermería.
• Laboratorios clínicos.
• Estudios de imágenes y radiografía.
• Ambulancias.
• Rehabilitación física o mental, incluyendo psicología y tratamiento de adicciones.
• Nutrición, dietética y quiropráctica.

No entran en la exención los servicios veterinarios, los seguros médicos (que tienen su propio tratamiento fiscal) ni los servicios de fumigación.

Los medicamentos están exentos, junto con prótesis, sillas de ruedas y vehículos para personas con discapacidad. En cambio, el material gastable y los equipos médicos generales no están necesariamente exentos: verifica producto por producto contra el listado de bienes exentos antes de configurarlos.

El efecto que casi nadie calcula: el ITBIS que pagas y no recuperas

Aquí está la trampa financiera del sector. Como tus servicios son exentos, no cobras ITBIS. Pero cuando compras insumos gravados, equipos, servicios de mantenimiento o publicidad, sí pagas ITBIS. Y como no tienes ITBIS por pagar contra el cual acreditarlo, ese impuesto se convierte en un costo.

Por eso una clínica tiene que ser especialmente rigurosa con el registro de sus costos: el ITBIS pagado forma parte del costo real del insumo, no es un crédito recuperable. Si tu operación mezcla servicios exentos con actividades gravadas, entra la regla de proporcionalidad y hay que tener la información separada desde el origen.

2. Un acto médico, dos facturas

Cuando un paciente asegurado se atiende, el monto se divide: una parte la cubre la ARS según póliza y otra la paga el paciente como copago o deducible. La práctica aceptada en el sector es emitir dos comprobantes separados: uno a la aseguradora por su porción y otro al paciente por la suya.

Es decir, ambos son contraparte fiscal, cada uno por su parte. No es que la ARS sea el único cliente. Conviene documentar el criterio que aplica tu clínica y validarlo con tu contador, porque este esquema responde más a práctica sectorial establecida que a una norma específica publicada para el sector.

3. Los honorarios médicos llevan retención

Cuando una clínica u hospital (persona jurídica) paga a un médico persona física por sus servicios profesionales, aplica la retención del 10% de ISR sobre honorarios profesionales.

Sobre el ITBIS: dado que el servicio médico está exento por el artículo 344, en la práctica no hay ITBIS que retener sobre el honorario médico. La retención de ITBIS solo entraría si el médico facturara aparte algún concepto que sí esté gravado.

4. La clínica está obligada como cualquier otro negocio

La DGII ha sido explícita: médicos y clínicas están obligados a emitir comprobante fiscal igual que cualquier establecimiento comercial o profesional liberal. El calendario que aplica es el general de la Ley 32-23 según la categoría de contribuyente:

• Clínicas clasificadas como grandes o medianas: ya vencido el plazo (15 de noviembre de 2025 o antes).
• Consultorios individuales y centros pequeños clasificados como pequeños, micro o no clasificados: hasta el 15 de noviembre de 2026.

Cómo se resuelve esto en Digimart

Digimart tiene un módulo de Gestión Médica construido para este flujo, no una adaptación de un módulo de ventas.

Configuración previa

• Médicos: ficha de cada doctor, con su usuario del sistema asociado y la configuración de su receta.
• Aseguradoras (ARS): el catálogo de aseguradoras con las que trabajas.
• Credenciales por médico y ARS: porque cada doctor tiene su propio código ante cada aseguradora, y ese dato es el que la ARS exige en la reclamación.
• Tarifario: los precios por procedimiento, incluyendo el tarifario particular para pacientes sin seguro.
• Plantillas de consulta: para que registrar una consulta no sea escribir desde cero cada vez.
• Catálogo de medicamentos para las recetas.
• Configuración de facturación ARS: cómo se arma la facturación de fin de período.

El día a día

• Sala de Espera: un tablero con carriles por estado del turno. Las citas confirmadas entran como agendadas y el check-in las mueve al flujo del día.
• Pacientes: el expediente completo, con un indicador de quién está en consulta en ese momento.
• Registro de consulta: con la plantilla del médico y la receta.
• Facturar la consulta: desde la Sala de Espera se pasa directo a facturar. Con seguro se cobra el monto a cargo del paciente; sin seguro, el precio completo del tarifario particular. Los procedimientos adicionales se agregan a la factura.
• Reclamaciones ARS: el pipeline de lo que está pendiente de cobrar a las aseguradoras, con sus estados.
• Facturación a aseguradoras: al cierre de período se generan las facturas a cada ARS.

Un detalle contable importante

Lo que está en reclamación todavía no es una cuenta por cobrar: es un pipeline previo a la factura. Una vez facturada la ARS, sí entra a Cuentas por Cobrar. Confundir ambas cosas es la forma más rápida de contar dos veces el mismo ingreso.

Citas y sala de espera

La integración de Citas con la Sala de Espera permite que una cita confirmada aparezca directamente en el tablero del día como "Agendado", y el check-in registre la llegada real del paciente. Hay además un navegador por día para ver la agenda de cualquier fecha.

Turnos y atención al público

Para centros con volumen alto de pacientes, el módulo DigiTurno gestiona la fila de espera con categorías de atención, operadores e historial.

Reportes del sector

Además de los reportes fiscales estándar (606, 607, 608, IT-1, IR-17), Digimart incluye reportes que el sector necesita, entre ellos el Reporte SNS. Todos los reportes fiscales se alimentan de los mismos documentos, así que el cuadre entre el IT-1 y el 607 deja de ser un ejercicio manual.

Errores frecuentes del sector

1. Cobrar ITBIS sobre una consulta médica. Está exenta por el artículo 344. Configura el producto o servicio como exento, no con tasa cero por descuido.
2. Tratar el ITBIS de las compras como crédito recuperable. Si tus servicios son exentos, ese ITBIS es costo. Registrarlo como crédito infla el activo y descuadra el IT-1.
3. Facturar todo a la ARS, incluyendo el copago. El copago lo paga el paciente y le corresponde su propio comprobante.
4. No retener el 10% a los médicos. La clínica es agente de retención y responde por lo no retenido.
5. Contar la reclamación como cuenta por cobrar. Duplica el ingreso reportado.
6. No tener las credenciales del médico ante cada ARS al día. Es la causa número uno de reclamaciones devueltas.
7. Asumir que un consultorio pequeño está exento de facturar. No lo está: solo tiene un plazo distinto.

Lista de verificación antes de migrar a e-CF

• Confirma tu categoría de contribuyente y tu fecha límite en la Oficina Virtual.
• Revisa la configuración de impuestos de tus servicios: los exentos deben estar marcados como exentos.
• Ten el RNC de cada ARS correcto: son tus clientes de e-CF 31.
• Define el criterio de doble facturación (ARS + paciente) con tu contador y documéntalo.
• Configura las retenciones de honorarios médicos.
• Actualiza el tarifario y las credenciales por médico y ARS.
• Si aún no estás obligado, evalúa habilitarte antes para acceder al crédito fiscal por implementación de la Ley 32-23.

Guías relacionadas

• Gestión Médica — la guía completa del módulo.
• Cómo implementar la facturación electrónica con Digimart
• Plazo Límite de la Facturación Electrónica en República Dominicana
• Comprobantes Fiscales (NCF)

Aviso

Material informativo, no asesoría fiscal individual. Las exenciones, retenciones y bases legales citadas están vigentes al momento de redactar; confirma tu caso con tu contador o en dgii.gov.do.